Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POTEB3A0JP26 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms