Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP16Q9Y5T5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP16Q9Y5T5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP16Q9Y5T5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP16Q9Y5T5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms