Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB2Q9Y5E7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms