Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms