Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms