Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ4Q9Y3A0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms