Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRG3Q9Y2Y8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms