Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SBNO2Q9Y2G9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBNO2Q9Y2G9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms