Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms