Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC11AQ9Y240 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC11AQ9Y240 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC11AQ9Y240 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC11AQ9Y240 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC11AQ9Y240 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC11AQ9Y240 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms