Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms