Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
HDAC5Q9UQL6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms