Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN6Q9UQ52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms