Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms