Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA12Q9UN75 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms