Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN2Q9ULH4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN2Q9ULH4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms