Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN16Q9UKR8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms