Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms