Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA4Q9UI42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms