Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms