Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms