Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms