Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL13Q9P2N7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms