Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms