Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHRF1Q9P1Y6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms