Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMG20BQ9P0W2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms