Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM248Q9NWD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms