Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00846Q9NV44 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms