Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
RRP7BPQ9NSQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RRP7BPQ9NSQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms