Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4Q9NRS4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms