Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAR1AQ9NR31 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms