Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD163L1Q9NR16 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD163L1Q9NR16 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms