Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms