Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms