Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN4Q9NQP4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN4Q9NQP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN4Q9NQP4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms