Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms