Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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