Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf88Q9H8K7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms