Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms