Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms