Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms