Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDCBP2Q9H190 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms