Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG9Q9H0W8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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