Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHARPINQ9H0F6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHARPINQ9H0F6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms