Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms