Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2OQ9C0C9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms