Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms