Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSDMCQ9BYG8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms