Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDHR2Q9BYE9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms