Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms